卫所，经年累月顶风冒雪奔波劳顿，才能换得那少得可怜的几两仪程的辛苦钱，哪里比得上武选、武库和车驾三司官员坐在安逸舒适的衙门里喝着茶扯着闲篇收银子那么爽？此外，边境一旦有事，职方司还要审阅九边重镇火速上呈的作战方略，确定打不打、如何打，肩上的责任十分重大。但是，打胜了是兵部堂官和九边督抚、将帅的功劳，人家升官发财、封妻荫子，他们顶多能讨口汤喝；打败了却要承担责任，罢官充军、抄家灭族都有可能。说起来，职方司职责之重、权力之大，在兵部四司之中，大概也只有武选司可以与之相提并论，从郎中到主事终日忙得不亦乐乎，却实实在在是“又穷又忙”。
又反复斟酌了一会儿，朱厚熜才下定了决心，还是向明朝以文统武的朝廷规制、祖宗家法和传统观念妥协，点头道：“你想的不错，职方司职责范围确实与朕心中构想的总参谋部职能大致相当，可见你是经过了深思熟虑的。那么，依你之见，若是总参谋部归由兵部掌管，总参谋长一职由谁出任较为适宜？”
御前办公厅职能与内阁相近，也是皇上的顾问机构，尤其是收回了司礼监批红大权之后，两位办公厅协办高拱和严世蕃，甚至包括那些还只是未曾实授官职的翰林院庶吉士的办公厅秘书们，