经进抵马六甲城下，从陆路发起了攻击。而驻守马六甲城的佛朗机人不过区区二千五百人，即便加上从当地印度人、缅甸人和爪哇人中临时招募的雇佣军，总计也不过六千人，装备只是那些已经被大明军队淘汰的火绳枪、佛朗机炮等火器；又没有战船，如何能挡得住大明远征军和鏖内柔佛王朝兵马海陆两路的夹击？也就是说，南路巡防分舰队虽然说是一支偏师，对付马六甲城的夷人完全是以众击寡，甚至可以说是持强凌弱、胜之不武。
事实上，大明远征军的确是有些“持强凌弱”的意思——和戚继光在吕宋战役中炮击水寨扬刀立威的作法一样，拥有制海权的南路巡防分舰队将全部战舰调至马六甲港，利用舰上的大口径火炮向佛朗机人的要塞发起了猛烈的轰击。三轮炮击之后，要塞的城墙就被炸开一个巨大的缺口，驻守要塞的两千名佛朗机兵士非死即伤，根本无力抵挡大明海军陆战队的进攻。而在要塞失陷之后，当南路巡防分舰队将炮口对准马六甲城，还未开炮，城中近四千名由当地印度人、缅甸人和爪哇人拼凑起来的雇佣军就哗变了，杀死了督战的佛朗机军官和士兵，竖起了白旗，向大明远征军投降。也就是说，此战既没有吕宋战役那样有舌灿莲花的说客说得敌人弃械来归；也没有足智多谋的军师运