倭寇最惧者莫过于俞大猷和戚继光两人，而俞大猷却被总督胡宗宪诬陷入狱，倭寇们得知此情后无不欢天喜地，竟大宴五日以示庆祝。后倭寇们探知漳州守将遗孤马雨筱欲持宝刀上京为俞大猷鸣冤，各路倭寇纷纷派遣高手，甚至出动忍者沿途追杀马雨筱，谁知马雨筱无巧不巧地被“病魔”尉迟朝峰劫持，逃过各路倭寇和忍者的围追堵截。
“病魔”尉迟朝峰虽属魔教中人，行事向以自我为中心，但也同样憎恨无恶不作的倭寇，自他遇上马雨筱后，不知斩杀了多少追杀马雨筱的倭寇忍者。他虽十分同情马雨筱的处景，但并未有想要助马雨筱完成父命的想法，只想将马雨筱带在身边。马雨筱被他带往枫林山庄，无形中又躲过了许多倭寇的追杀，但仍有小部分倭寇探知马雨筱的行踪一路追了下来。
倭寇又有真假之别，真倭纯属外敌，假倭乃一些武林败类和一些自甘为盗的人渣身着倭服扮成，真、假倭寇常常沆瀣一气，作起恶来不分彼此。前日杜奇等人找寻李时珍时在玄妙观中所遇的十余名忍者便是追杀马雨筱的一股真倭忍者，而今夺官兵水师战船追来的倭寇中真假皆有，与林木对话那人显然便是一个假倭寇，而被鲁妙儿一剑击毙的无疑便是一个真正的倭寇，而且是倭寇中身具奇术者忍者！