，万物仿佛投射出人类的思想，这就产生了万物有灵的概念。
第二个阶段，是人格神的阶段。这是典型的将心比心的产物。比如上帝长得跟人一样，有感情和思想。比如菩萨在庙子内供奉，长的是人的模样。古代希腊的神话中，大量神仙与人类一样，有充沛的感情，有错误有冲动，甚至有恶劣和卑鄙，这些都是人格神最丰富的表现。“子不语怪力乱神”，也是指的人格神。
第三个阶段，是非人格神阶段。神不是一种人，而是一个道理，一个规律。这种神的出现，就打破了偶像崇拜的习惯，进入到纯粹思维的世界中了。这是人类思维体系完全系统化并自洽的阶段，这是人类自已在内心中创造的伟大世界。
但以孔子当时阶段的人类思维水平，可能无法完全摆脱人格神对人类思维和情感的影响，于是他采取了一个过渡性的办法：用祖先崇拜取代鬼神崇拜，这样百姓也好接受，效果还比较好。虽然今天这种方式有很多弊病，但在当时，是进步的。
逻辑是一种思维方式，完全摆脱了神的束缚，连神的名称都不需要。因为它的强大，完全不需要神秘力量的护佑。它从一产生，就强烈地改变着世界。
当人类掌握了逻辑的工具后，实验得出的现象