意思是位置不定，凭气机的自然生发运转而定。
本书采用李西月《道窍谈》说法“玄关一窍，自虚无中生。不居于五脏六腑，肢体间无论也。今以其名而言：此关为玄妙机关，故曰玄关。此窍为万法归一之地，有独无对，故曰一窍。一言以备之曰：中是也。中在上下之中，亦不在上下之中，有死、有活故也。何谓死？以黄庭、炁穴、丹田为此中，就是死的。何谓活？以凝神聚炁，现出此中，就是活的。以死的论，就叫做黄庭、炁穴、丹田。以活的论，乃算做玄关一窍。故曰：自虚无中生。真机直露。得者秘之。”分为死玄关和活玄关，死玄关位置确定，活玄关位置不定，或与上丹田、中丹田、下丹田相合，或者杳杳冥冥之中。
关于玄关一窍的作用，一是“玄窍开时窍窍开”，人体各处玄关遍开；二便是“天地之根，结丹之处”，如果实在无法开活玄关，那就要用秘法开死玄关中的秘窍，在三丹田之一结丹。
附：和笑傲中比较参照：
王处一和向问天脚上功夫描述：
那道人（王处一）并不答话，伸出左足向前踏了一步，随即又缩脚回来，只见地下深深留了一个印痕，深竟近尺，这时大雪初降，地下积雪未及半寸，他漫不经意地伸足一踏，竟连雪