战船是水军作战的载体和平台，其质量优劣，关乎着水战的成败，这也是赵昺最熟悉的领域，因此他决定还是从改造战船下手。虽然古今的战船结构和差别很大，但万变不离其宗。原理还是一样，尤其是他有着多年制作古船模的经验，对于这方面还是有信心的。赵昺穿越以来，经历了两次遇险后一直对龟船情有独钟，因此想以其为蓝本打造大宋版的龟船。
可赵昺还面临着一个时间的问题，他前世作为有经验的工程师，知道一艘新船从设计、定型，到制造和试航需要一个较长的周期，甚至要消耗数年的时间。如今自己拥有龟船的船模，这是完全按照比例制作的。可以跳过设计环节，但要完全制造一艘新船仍需要时日，尤其是在当前制造技术和方式还处于全手工的时代，因而他对现有船只进行改造是比较妥当的办法。
现在赵昺的手头有不少船。再不是在甲子镇时担心连自己这点人都拉不走的时候了，而到广州后又抄没和缴获了一批船，如今大小都加上足有七百多艘，当然其中还有不少民船。但这个时代民船和战船采用的船体基本相同，只有上层建筑和配置有所区别，甚至不需改造拿来便能利用。即便在朝廷所领水军之中都有许多征用的民船和在泉州抢来的商船充当战船。