将新兵暂编成三个大队，一营分成四个中队，每个中队分成四个分队，每个分队分成四个小队。平时以大队为基础进行管理，训练和学习以中队为单位进行，当前各大队由军事教官和文化教官兼任队长和虞侯，中队长和分队长由侍卫营中的原基层军官担任，小队长则由新兵中挑选有经验的老兵担任。
按照赵昺的计划，今年的一千五百人只是第一期，明年将招募第二期新军。待第一期训练完毕后以这些学员为骨干扩编成一个基干旅，在第二期毕业后进行二次扩编，将御前护军编成三个旅的基干示范师。自第三期在正常征募学员外，开始对准备进行改装的各部基层军官进行为期一年的轮训，然后与同期毕业的学员一同分配到各军进行换装。
在取得经验后开办将校班，对中、高层军官进行培训，学习热兵器的战术指挥和运用。于此同时各军开始按照新条例和条令进行训练，为换装打下基础，争取在五年内完成十个步兵师、两个或以上的骑兵师、三个身管火炮旅的换装；而水军则要在完成部分新式战船的改装的同时，编成三个陆战师和一个炮旅的任务。
赵昺当然是想打造一支更为强大的军队，能有个百、八十万最好，但是他不得不考虑琼州的承受力，行朝的财力和人口的数