漕运码头，驻扎两千登莱新军的将士，其余的漕运码头驻守一千登莱新军将士，这样驻扎漕运码头的军士接近三万人，剩余的军士，重点驻扎在淮安府城、徐州州城、庐州府城等地，兼顾辖下的县城，至于说凤阳府城，因为其特殊的地位，暂时没有派驻登莱新军进驻。
仅仅用了半个月的时间，登莱新军全部安排部署到位。
江北四镇三州的地方官府，同样没有什么反弹的情绪，反正驻扎本地的登莱新军，没有插手官府的任何事宜，与他们没有太大的关系，相反，登莱新军进驻府州县，能够迅速稳定地方的局势，地方官府高兴还来不及。
登莱新军驻扎到位之后，卢发轩随即开始全面整改漕运之中的弊端。
吴宗坤兼任山东巡抚，曾永忠也抵达济南府城，协助吴宗坤管辖山东的所有事宜，戴明杰出任登州知府，实际负责登州和莱州的诸多事宜，行使登莱巡抚的职责。
安排完毕江北四镇三州以及漕运的诸多事宜，吴宗睿也回到了山东。
廖文儒则是直接回到了锦州，开始统领驻扎辽东的登莱新军。
离开淮安府城的吴宗睿，对于江北四镇三州的局势没有完全放心，他还有一个最为重要的事情没有处理，那就是