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车厢峡四面山石陡峭，中间长达四十里，易进难出。
贼兵误入其中，当时山上也住着不少百姓，他们见陈奇瑜率领各省官军来剿贼，都是奋勇配合，流贼大军经过的时候就在山上扔石头、扔火把。
陈奇瑜迅速令人在山口垒起石寨，驻军严防，切断流贼的进出通路，坐视糜烂中原的流贼在自己手上被清剿一空。
当时正是大雨倾盆，连下二十天大雨，流贼兵器都丢的差不多，而且马没有草吃，没多久便饿死了不少人，就连老营兵都是毫无战心，可以说是败局已定。
这个时候只要官军进逼上去，可以轻而易举的将流贼一举歼灭。
不过历史上陈奇瑜显然没有这么做，他没有让跃跃欲试的官军进入车厢峡围剿，却只是在外继续围困，坐观成败。
这个时候，虽然陈奇瑜对流贼取得了重大胜利，但黄台吉二次亲征察哈尔，建奴四出，苦掠宣、大，引起京畿轰动。
在这种情况下，历史上的崇祯皇帝显然没有耐心去等陈奇瑜。
在朝廷不断的催逼，还有周围将领的唆使之下，陈奇瑜犯下了此生唯一，也是最大的一个错误，接受李自成、张献忠的投降，收编了三万多老营贼兵。